در هنگام غذا خوردن یک شیره بزاقی به دهان ترشح می‌شود و این بزاق سبب تسریع در پایین رفتن غذا به درون مری شده، که آب خوردن در بین غذا باعث مختل شدن کار این بزاق و همچنین دیگر آنزیم‌های موجود در دهان می‌شود.

سلول‌های پوشاننده دیوار معده و روده در اثر آب خوردن بین غذا تضعیف و همین امر باعث هضم ناقص غذا و در نتیجه احساس ترش کردن معده و ایجاد نفخ در افراد می‌شود.

آب خوردن بین غذا ph بدن را متغیر می‌کند،زمانی که بین غذا آب مصرف می‌کنیم، شیره موجود در معده رقیق شده و کار هضم معده به هم می‌ریزد و سبب دل درد شدید می‌شود.

کسانی که از کولیت روده رنج می‌برند مطلقاً از نوشیدن آب بین غذا خودداری کنند، زیرا این عمل سبب ضعیف شدن دستگاه گوارش و همچنین سوءهاضمه می‌شود.

نوشیدن آب در بین غذا سبب هضم شدن موادی همچون نشاسته و چاقی بیش از حد بلغمی و همچنین سبب یبوست مزاجی افراد می‌شود.

مصرف آب در بین وعده‌های غذا سبب از بین رفتن آنزیم نسالین و ماده مولین که لعاب معده را می‌پوشاند شده، که در نتیجه فرد دچار زخم معده و اثنی‌عشر می‌شود.